Berikut ini adalah feature tambahan yang dapat diperoleh dalam game Yu-Gi-Oh! GX: Spirit Caller yang ada di Nintendo DS, feature tersebut dapat dibuka dan didapatkan bila telah memenuhi syarat. Beberapa feature tambahan tersebut seperti seragam dan duel disk yang akan memberikan tampilan berbeda.
Duel Disk
Kalahkan karakter berikut berulang-ulang, hingga mereka memberikan duel disk yang mereka miliki.
- Alchemy Disk: Professor Banner
- Amazonness Disk: Tania
- Gorgeous Disk: Admiral
- Kaibaman Disk: Kaibaman
- Pharaoh Disk: Abidos
- Vampire Disk: Camula
Duel Uniforms
Terdapat beberapa seragam (uniform) yang dapat digunakan dalam game ini untuk mengubah penampilan. Berikut seragam dan syarat untuk mendapatkannya:
- Academy Jersey: Kalahkan Fonda hingga ia memberikannya
- Black Uniform: Kalahkan Chazz hingga ia memberikannya
- Blue Uniform: Kalahkan Dark Zane hingga ia memberikannya
- Duel Coat: Kalahkan Crowler hingga ia memberikannya
- Hawaiian Shirt: Kalahkan Atticus hingga ia memberikannya
- Kaibaman Coat: Kalahkan Kaibaman hingga ia memberikannya
- North Academy Uniform: Kalahkan Chazz hingga ia memberikannya
- Stuffy Collared Shirt: Lakukan link dengan game Yu-Gi-Oh! Nightmare Troubadour
- Suit: Kalahkan Chumley hingga ia memberikannya
- Titan Coat: Kalahkan Titan hingga ia memberikannya
- Yellow Uniform : Kalahkan Professor Sartyr hingga ia memberikannya
Duel Spirits
Ada 16 duel spirits yang dapat dijadikan partner, namun hanya 1 saja yang dapat digunakan dalam sebuah duel. Kemunculan dari duel spirits tersebutm, terjadi secara random di malam hari. Untuk menjadikan mereka partner harus dengan mengalahkan mereka terlebih dahulu dalam duel. Setelah menang ada kemungkinan mereka akan bergabung bila beruntung, atau pergi begitu saja.
- Acrobat Monkey: Kalahkan Kagemaru
- Adhesive Explosive: Merupakan starter sejak awal yang dapat ditemui di sumur, Well
- Babycerasaurus: Setelah penentuan finalists pada tournament
- Batteryman C: Selesaikan cerita utama game
- Batteryman D: Selesaikan cerita utama game
- Beelze Frog: Setelah penentuan finalists pada tournament
- Blast Asmodian: Setelah penentuan finalists pada tournament
- Dragon Capture Jar: Selesaikan cerita utama game
- Ebon Magician Curran: Setelah event Abandoned Dorm
- Hane-Hane: Kalahkan Bastion untuk kedua kalinya
- Jerry Beans Man: Merupakan starter sejak awal yang dapat ditemui di sumur, Well
- Oscillo Hero #2: Merupakan starter sejak awal yang dapat ditemui di sumur, Well
- Skelengel: Kalahkan Kagemaru
- Soitsu: Setelah event Abandoned Dorm
- Star Boy: Kalahkan Bastion untuk kedua kalinya
- White Magician Pikeru: Selesaikan cerita utama game
Dropout Boy: Gelar yang diperoleh setelah kalah duel sebanyak 475 kali.
King of Duels: Gelar yang diperoleh setelah menang duel sebanyak 475 kali.
Berikut ini ialah cheat Action Replay (AR) Yu-Gi-Oh! GX: Spirit Caller region North America untuk NDS.
Infinite DP
021058CC 000F423F
Code ini akan memberikan 999999 DP
Infinite LP
122CF08C 00001F40
122D1A3C 00001F40
Instant Win
122CF8F4 00000000
122D1A40 00000000
Code ini akan membuat LP lawan langsung menjadi 0
One Hit Kill
822CF8F4 00000001
122CF8F4 00000001
822D1A40 00000001
122D1A40 00000001
Have All Outfits
927FFFA8 FBFF0000
C0000000 00000003
121058D4 00000FFF
DC000000 00000003
D2000000 00000000
D0000000 00000000
Have All Disks
C0000000 00000003
221058D6 000000FF
DC000000 00000002
D2000000 00000000
Have All Spirits
C0000000 00000002
121058E0 0000FFFF
DC000000 00000003
D2000000 00000000
Quick Level Up
021058C0 0000FFFF