Lokasi dalam game Harvest Moon: The Tale of Two Towns adalah area pegunungan, tidak ada area pantai. Dimana area pantai menjadi salah satu spot andalan untuk memancing dalam beberapa seri Harvest Moon lainnya. Dalam game Harvest Moon: The Tale of Two Towns ini terdapat dua cara menangkap ikan yakni dengan tangan kosong dan dengan menggunakan Fishing Rod.
Menangkap ikan dengan tangan kosong dapat dilakukan sejak awal game, sedangkan Fishing Rod baru dapat diperoleh pada Summer 1, dari Rutger bila tinggal di Bluebell, atau Ina bila tinggal di Konohana. Menangkap ikan dengan tangan kosong tidak dapat dilakukan pada musim dingin (Winter), saat air sungai kecil membeku. Ukuran ikan yang bisa ditangkap dengan tangan kosong juga kecil. Untuk menangkap ikan yang berukuran sedang dapat mengunakan Fishing Rod.
Adapun upgrade dari Fishing Rod, yakni Master Rod dapat digunakan untuk menangkap ikan langka berukuran besar dan juga King Fish. Untuk mendapatkan Master Rod ada beberapa syarat yang harus dipenuhi yakni harus berteman baik dengan Rutger dan telah mencapai request level 3. Untuk mendapatkan Master Rod dari Rutger, terlebih dahulu harus menyelesaikan request yang diberikannya. Rutger akan memberikan request level 3, dengan meminta 10 Old Boot dan 10 Old Ball, yang nantinya akan diganti dengan hadiah Master Rod.
Jenis ikan yang dapat ditangkap dalam game ini berbeda-beda, tergantung pada musim apa dan juga jam berapa dalam game. Setelah bertemu dengan Oracle, ia akan menawarkan membuat beberapa item. Salah satunya adalah Angler's Dream, yang akan memudahkan memancing dengan Fishing Rod atau Master Rod. Efek dari Angler's Dream hanya bertahan 1 hari. Untuk King Fish dalam game ini hanya bisa ditangkap dan kemudian dilepaskan kembali ke alam bebas. Meski begitu akan tetap ada catatan tentang tangkapan King Fish tersebut. Adapun dalam game Harvest Moon: The Tale of Two Towns, terdapat lima King Fish, yang bisa ditangkap, yakni.
- Snapping Turtle, berukuran 30 cm, ditangkap dengan tangan, saat Summer dalam cuaca Stormy
- Dragon Carp, berukuran 155 cm, ditangkap saat Spring dalam cuaca Sunny
- Giant Catfish, berukuran 170 cm, ditangkap saat Summer dalam cuaca Rainy
- Giant Salamander, berukuran 185 cm, ditangkap saat Fall di tengah malam
- Giant Hutchen, berukuran 200 cm, ditangkap saat Winter, dengan menggunakan Master Rod, terlebih dahulu harus menangkap Giant Salamander, Dragon Carp, dan Giant Catfish