Ada banyak fasilitas bangunan yang ada dalam suatu kerajaan di Pokemon Conquest, seperti toko, tambang, taman, gua tempat berburu Pokemon liar, dan lain sebagainya. Ada dua cara untuk meningkatkan level fasilitas dalam game Pokemon Conquest ini yakni dengan mendelegasikan tugas tersebut atau melakukannya sendiri.
Untuk mendelegasikan suatu kerajaan dengan memilih suatu kerajaan yang telah dikuasai, tapi tokoh utama dalam jalan cerita tersebut tidak berada di kerajaan itu, pilih Delegate, akan ada tiga pilihan yakni:
- Train, berlatih dengan partner Pokemon
- Search, mencari warrior dan Pokemon baru
- Develop, mengembangkan level fasilitas kerajaan sekaligus mencari emas (gold) bila di kerajaan tersebut terdapat tambang emas
Sedangkan bila melakukan sendiri dapat dengan langkah:
- Masuk ke suatu kerajaan
- Pilih Bank, untuk melakukan investasi peningkatan level fasilitas kerajaan
- Pilih warrior mana saja yang disertakan
- Pilih lokasi fasilitas yang ingin ditingkatkan serta jumlah gold untuk investasi
- Bila bar level penuh, fasilitas akan naik level
Manfaat meningkatkan level fasilitas ialah untuk mendapatkan service fasilitas yang lebih baik, membuka fasilitas baru, dan yang terpenting ialah menjadi salah satu syarat untuk mendapatkan Legendary Pokemon. Saat memulai cerita game Pokemon Conquest yang baru semua gold dan fasilitas akan reset, jadi fasilitas yang ditingkatkan di cerita sebelumnya tidak ikut dalam jalan cerita baru. Hanya partner Pokemon saja yang dibawa.
Lihat juga mengenai daftar perfect link setiap warrior dengan partner Pokemon.