Berikut informasi sejarah asal region di game Pokemon.
Kanto
Kanto merupakan region pertama dalam seri Pokemon, dan berada di sisi Timur dari region Johto dan Selatan dari Sinnoh. Seluruh kota di Kanto berdasarkan nama warna, semisal Viridian City, Lavender Town, Indigo Plateu, kecuali untuk Pallet City. Daerah Kanto di Jepang menjadi dasar region Kanto di cerita Pokemon.
Para peneliti di Kanto yang dikendalikan oleh Team Rocket, melakukan percobaan genetic pada Mew, untuk menciptakan Mewtwo. Selain itu Porygon, Virtual Pokemon juga diciptakan di Kanto.
Johto
Johto merupakan region kedua dalam seri Pokemon, dan berada di sisi Barat dari region Kanto dan Selatan dari Sinnoh. Kanto dan Johto dipisahkan oleh Indigo Plateu. Daerah Kansai di Jepang menjadi dasar region Johto di cerita Pokemon. Kanto lebih modern dibandingkan Johto, yang lebih menjaga tradisi.
Peradaban kuno di Johto, tepatnya di Ruins of Alph mengembangkan sistem huruf alphabet berdasarkan Unown. Terdapat Brass Tower di Barat dan Bell Tower di Timur, dulunya tempat Lugia dan Ho-Oh berada. Ketika Brass Tower terbakar, terdapat tiga Pokemon yang terjebak di dalamnya. Ho-Oh kemudian muncul dan membangkitkan tiga Pokemon tersebut menjadi Raikou, Entei, dan Suicune. Celebi sang penjaga hutan membantu menghentikan kebangkitan Team Rocket.
Hoenn
Hoenn region terletak di sisi Selatan dari Sinnoh region. Pulau Kyushu di Jepang, menjadi inspirasi design Hoenn. Bila dibandingkan dengan Kyushu, tata letak Hoenn sedikit berbeda. Tata letak Hoenn berdasarkan tata letak Kyushu yang diputar 90 derajat berlawanan dengan arah jarum jam.
Hoenn region dibentuk oleh Primal Groudon dan Primal Kyogre. Primal Groudon membentuk dataran tanah, sedangkan Primal Kyogre mengisi lautan di Hoenn. Pertempuran keduanya dihentikan oleh Mega Rayquaza. Pergeseran benua yang terjadi menyebabkan Regigigas tersegel di Snowpoint Temple di Sinnoh region, sedangkan kunci untuk membuka Regigigas yakni Registeel, Regirock, dan Regice, tersegel di Hoenn.
Sinnoh
Sinnoh region berada di Utara dari Kanto, Johto, dan Hoenn. Berdasarkan cerita sejarah Pokemon, Sinnoh merupakan region pertama yang ada di dunia Pokemon. Arceus, Pokemon pertama dalam sejarah cerita Pokemon, menciptakan Dialga, Palkia, dan Giratina. Dialga mendapat tugas menjaga waktu dan Palkia menjaga ruang, sementara Giratina dikirim ke dimensi lain oleh Arceus. Arceus juga menciptakan Azelf, Uxie, dan Mesprit para penjaga manusia dan Pokemon. Para Lake Guardian tinggal di Lake Valor, Lake Acuity, dan Lake Verity di Sinnoh. Sinnoh dibagi menjadi dua area yang dipisahkan oleh Mt. Coronet. Sementara itu Heatran terlahir dari lava yang ada di Stark Mountain. Arceus juga menciptakan Adamant, Lustrous dan Griseous Orb sebelum menghilang ke Hall of Origin.
Dahulu Floaroma Town merupakan daerah yang gersang dan tidak ada bunga disana. Para warga disana mencoba menanam bunga untuk membuat suasana lebih hidup dan indah. Namun sia-sia bunga tidak dapat tumbuh, hingga Shaymin datang dan membuat bunga-bunga tumbuh dan mekar begitu indah.
Junichi Masuda mengungkapkan bahwa nama Sinnoh memiliki arti misterius. Area Sinnoh berdasarkan Pulau Hokkaido di Jepang. Banyak tata letak kota di Sinnoh menyerupai tata kota Jepang. Jubilife City berdasarkan Sapporo, Veilstone City berdasarkan Abashiri. Tiga danau di Sinnoh berdasarkan Danau Toya, Kussharo, dan Kutcharo.
Unova
Unova region menjadi setting Pokemon Black, White, sekaligus sequel Black version 2, White version 2. Inspirasi dari Unova ialah New York City, sehingga terlihat jelas sangat berbeda dengan region sebelumnya, yang menggunakan gaya Jepang.
Unova region tercipta dari usaha Pahlawan Kembar dan Pokemon Dragon. Perbedaan pendapat antara dua saudara tersebut, dimana sang kakak menginginkan gagasan kebenaran apa adanya, sedangkan sang adik menginginkan sesuatu yang ideal. Hal tersebut membuat Pokemon Dragon tersebut membelah menjadi Reshiram yang ada pada pihak sang kakak, dan Zekrom di pihak sang adik.
Selain itu terdapat perang saudara yang menyebabkan kebakaran hutan. Hingga Swords of Justice yang beranggotakan Terrakion, Virizion, dan Cobalion menyelamatkan Pokemon yang ada di hutan.
Thundurus dan Tornadus pernah berbuat ulah di Unova yang menyebabkan banyak daerah rusak. Landorus kemudian menghukum keduanya. Dahulu Meloetta menghibur para penduduk Unova dengan nyanyiannya, hingga kesedihan mengisi hati penduduk Unova. Sehingga Meloetta kehilangan kekuatannya.