Dalam serial manga dan anime Naruto terdapat beberapa klan ninja yang memiliki kekuatan dan kelebihan yang unik. Berikut ini ialah beberapa klan penting yang ada dalam serial ini.
Aburame
Merupakan salah satu klan bangsawan yang ada di Konoha. Anggota klan ini memiliki kemampuan mengendalikan serangga. Beberapa anggota klan ini seperti Shino, Tatsuma, Shibi, Shikuro, Muta.
Akimichi
Akimichi merupakan salah satu klan bangsawan di Konoha. pemimpin klan Akimichi ke-15 ialah Choza Akimichi, sedangkan anaknya Chouji Akimichi menjadi penerus pemimpin ke-16. Anggota klan ini memiliki postur tubuh dan kekuatan yang besar dengan teknik menggunakan chakra Yang. Beberapa anggotanya seperti Chouji, Chouza, Chouchou.
Hatake
Klan Hatake dari Konoha, memiliki ciri khas yakni senjata pedang chakra yang dapat menghasilkan chakra saat diayunkan. Anggota klan ini ialah Sakumo dan Kakashi.
Hyuga
Merupakan salah satu klan bangsawan di Konoha yang memiliki kekkei genkai byakugan, yang dapat meningkatkan kemampuan penglihatan penggunanya, bahkan melihat aliran chakra dari lawannya. Klan Hyuga merupakan keturunan dari Otsutsuki dari garis Hamura. Beberapa anggota klan ini seperti Hinata, Neji, Hanabi, Hiashi, Hizashi.
Inuzuka
Merupakan klan yang terkenal dari Konoha dengan kedekatannya dengan anjing. Anggota klan ini memiliki kecepatan dan indera penciuman yang tajam seperti anjing. Beberapa anggotanya seperti Kiba, Hana, Gaku.
Kaguya
Salah satu keturunan Otsutsuki, ialah klan Kaguya. Anggota terakhir dari klan ini ialah Kimimaro. Klan ini memiliki kekkei genkai shikotsumyaku, yang dapat memanipulasi jumlah, tingkat kepadatan, dan bentuk tulangnya.
Nara
Merupakan klan yang terkenal akan kecerdasannya, sehingga tidak jarang anggota klan ini sering dijadikan penasehat para Hokage. Klan Nara memiliki ninjutsu khusus yang dapat digunakan untuk memanipulasi bayangannya dengan chakra Yin. Beberapa anggota klan ini seperti Shikamaru, Shikaku, Daen, Ensui, Maen, Shikadai.
Otsutsuki
Merupakan klan kuno yang berasal dari dunia lain dan muncul di Bumi sekitar seribu tahun sebelum alur cerita Naruto. Kaln Otsutsuki juga merupakan asal dari klan Senju, Uzumaki, Uchiha, Hyuga, dan juga Kaguya. Selain itu Otsutsuki juga mengembangkan teknik boneka yang digunakan oleh Kankuro. Kekkei genkai yang dimiliki oleh anggota klan ini ialah Byakugan, Sharingan, Mangekyo Sharingan, Rinnegan, dan Tenseigan. Contoh anggota klan Otsutsuki ini ialah Indra, Asura, dan Toneri.
Sarutobi
Anggota klan Sarutobi menduduki posisi penting di Konoha, sperti Hokage ketiga. Anggota klan ini terkenal dengan kekuatan semangat api yang dimilikinya dan sifat pantang menyerah. Beberapa anggotanya ialah Konohamaru, Asuma, Biwako, Hiruzen, Mirai.
Senju
Merupakan klan ninja terkuat di awal era ninja dan keturunan dari Asura Otsutsuki. Kekkai genkai yang dimiliki klan ini ialah teknik dengan elemen kayu. Anggota klan ini seperti Hashirama, Tobirama, Tsunade.
Uchiha
Merupakan salah satu klan bangsawan di Konoha, sekaligus yang paling kuat, berasal dari Indra Otsutsuki. Kekuatan klan ini terdapat pada kekuatan mata sharingan yang dimiliki garis keturunannya. Beberapa anggotanya seperti Madara, Sasuke, Itachi, Sarada, Obito. Klan Uchiha memiliki kekuatan dasar chakra dengan elemen api.
Uzumaki
Klan Uzumaki berasal dari Uzushiogakure dan memiliki kedekatan dengan klan Senju. Beberapa anggotanya seperti Naruto, Boruto, Himawari, Karin, Nagato, Kushina. Klan Uzumaki memiliki keunggulan dalam fuinjutsu, yakni teknik menyegel suatu benda atau makhluk hidup lainnya. Anggota klan ini memiliki daya tahan tubuh yang kuat, energi kehidupan yang tinggi, dan juga kemampuan menyembuhkan luka diri yang sangat baik.
Yamanaka
Klan Yamanaka memiliki teknik khusus yang digunakan untuk memanipulasi pikiran lawan. Selain itu juga ahli dalam melakukan interogasi dengan membaca pikiran musuh yang berhasil ditangkap. Beberapa anggota klan ini seperti Ino, Inojin, Inoichi, Fu.
Yuki
Anggota klan Yuki yang ada di serial anime ialah Haku. Sesuai dengan namanya Yuki, yang berarti salju, memiliki kekkei genkai yang dapat mengendalikan chakra es.
Lihat juga mengenai film Boruto dan kematian Naruto.